Plateau Cytométrie & tri cellulaire
Le plateau de cytométrie et tri cellulaire de l’Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires est rattaché à la Plateforme technologique des sciences du vivant Toulouse Réseau Imagerie (TRI), labellisée IBiSa. Le plateau, qui est certifié iso 9001 version 2015 et NF X50-900 version 2016, propose un ensemble de ressources et de compétences dédiées au tri cellulaire et à l’analyse par cytométrie en flux et en image. Ce plateau, intégré dans une zone de confinement L2, est équipé de 6 analyseurs, 3 trieurs de cellules et 1 cytomètre en image. Le personnel assure du conseil, de l’assistance, des formations ainsi que de l’enseignement à l’Université Toulouse III. Le personnel du plateau peut également vous accompagner dans la mise au point et le développement de projets de recherche sous forme de collaboration.
L'équipe
Responsables : F.E.L’Faqihi-Olive & V.Duplan-Eche
Prestations de service
Analyse et tri cellulaire à la demande des équipes de recherche appartenant à des organismes publics ou privés.
Recherche et Développement
Le personnel du plateau peut vous accompagner dans la mise au point et le développement de projets de recherche sous forme de formations et/ou de collaborations.
Formation, conseil, expertise
- Formation à l’utilisation des appareils
- Aide à la mise en place ou l’optimisation d’un protocole expérimental
- Mise en place de panels multicouleurs optimisés
- Aide à l’analyse et l’interprétation des résultats
- Expertises pour les laboratoires privés
- Formations continues
- Formations CNRS Entreprises
Applications
Analyse par cytométrie en flux
- Multimarquages membranaires
- Multimarquages intracelluaires
- Cycle cellulaire
- FRET
- Analyses multiplex
- Flux calcique
Analyse par cytométrie en images
- Comptage de spots
- Translocation nucléaire
- Autophagie
- Cycle cellulaire
- Internalisation
Tri cellulaire
- Tri haute vitesse
- 4 voies de tri
- Module de clonage
Retraitement des données
Formation et accompagnement aux logiciels dédiés à l’analyse des données de cytométrie en flux (FlowJo, Cytobank ) et en images (IDEAS)
Équipements
Trieurs de cellules
Caractéristiques communes
- Mesurer 12 fluorescences
- Vitesse de tri : 10000 à 30000 cellules/seconde, Possibilité de trier 4 populations simultanément, Unité de clonage
Équipements
- FACSARIA-SORP (BD Biosciences) 4 sources d’excitation (488nm, 630nm, 405nm et 355nm). Configuration (pdf)
- FACSARIA-II (BD Biosciences) 3 sources d’excitation (488nm, 630nm, 405nm). Configuration (pdf)
- FACSARIA-FUSION (BD Biosciences) 5 sources d’excitation (355nm, 405nm, 488nm, 561nm, 630nm). Configuration (pdf)
Cytomètres
- Symphony A5 (BD Biosciences) 5 sources d’excitation (355 nm, 405 nm, 488 nm, 561nm et 637 nm) mesure de 30 fluorescences. Configuration (pdf)
- Fortessa X20 (BD Biosciences) 5 sources d’excitation (355 nm, 405 nm, 488 nm, 561nm et 640 nm) mesure de 18 fluorescences. Configuration (pdf)
- LSR-Fortessa (BD Biosciences) 4 sources d’excitation (405 nm, 488 nm, 561nm et 633 nm) mesure de 16 fluorescences. Configuration (pdf)
- LSR II (BD Biosciences) 4 sources d’excitation (350 nm, 405 nm, 488 nm, 633 nm) mesure de 13 fluorescences. Configuration (pdf)
- MACSQuant10 (Miltenyi Biotec) 3 sources d’excitation 405nm, 488nm et 633nm mesure de 8 fluorescences. Configuration (pdf)
- MACSQuantVYB (Miltenyi Biotec) 3 sources d’excitation 405nm, 488nm et 561nm mesure de 8 fluorescences. Configuration (pdf)
Cytomètre en images
ImageStreamX MarkII (Merck)
- 3 sources d’excitation : 405nm, 488nm et 633nm
- 3 tailles d’objectif : 20x, 40x et 60x
- Collecte simultanément jusqu’à 6 images de chaque cellule à l’aide d’une caméra CCD
- Quantifie sur un grand nombre de cellules de nombreux paramètres morphologiques (forme, taille, intensité, localisation, internalisation…)
Contact & réservation
Une formation est obligatoire pour les personnes qui souhaitent travailler en autonomie sur l’ensemble des cytomètres. Chaque utilisateur doit remplir une fiche de demande et signer le règlement intérieur. Il doit faire une demande de validation avant de pouvoir se réserver en ligne sur les appareils.
Les personnes souhaitant une assistance ou les utilisateurs n’ayant pas accès au planning doivent prendre rendez-vous avec le personnel du plateau.
Pour les trieurs de cellules qui sont pilotés par le personnel, il est impératif de formuler sa demande de rendez-vous auprès du plateau.
Autres informations
Le comité de pilotage
Responsable scientifique : S. Laffont-Pradines
- F. Masson (Equipe N. Blanchard)
- R. Poupot (Equipe J. Ausseuil / R. Poupot)
- A. Dejean (Equipe A. Saoudi / L. Liblau)
- M. Requena (Equipe J. Izopet / B. Lagane)
- H. Martin (Equipe D. Dunia / C. Malnou)
- C. Pérals (Equipe N. Fazilleau / S. Guerder)
- A. Loste (Equipe N. Gaudenzio)
- O. Joffre (Equipe J. Van-Meerwijk / O. Joffre)
- N. Rouquié (Equipe R. Lesourne / L. Dupré)
- M. Savignac (Equipe J.C. Guéry)
- L. Reber (Equipe L. Reber)
- A. Marches (Equipe M. Simon)
- M. Diaz Munoz (Equipe M. Diaz Munoz)
- H. El Costa (Equipe N. Jabrane-Ferrat)
- S. Ménard (IRSD)
Publications
Formulaires de demande et liens utiles
Formulaires à remplir pour les nouveaux utilisateurs :
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